Molekularne techniki analizy RNA. Ćwiczenia - pdf

Prezentowane w publikacji techniki są obecnie stosowane w większości laboratoriów zajmujących się biologią molekularną, ale ciągle brak ich opisu w literaturze polskojęzycznej. Wykłady do fakultetu „Molekularne techniki analizy RNA” obejmują aktualny stan wiedzy na temat metabolizmu RNA u eukariontów oraz teorię technik pozwalających na badanie poziomu RNA w komórce, nowo syntetyzowanego transkryptu oraz badania oddziaływań białek uczestniczących w transkrypcji.

Na ćwiczeniach praktycznych studenci poznają wybrane techniki badania RNA na przykładzie organizmów modelowych: drożdży Saccharomyces cerevisiae oraz rzodkiewnika Arabidopsis thaliana.

Prezentacja metod jest ilustrowana odpowiednimi przykładami, w których studenci samodzielnie badają poszczególne rodzaje RNA, jak utajnione, niestabilne transkrypty CUT czy microRNA, i etapy ich metabolizmu. Skrypt ten zawiera zarówno wprowadzenie teoretyczne odwołujące się do najnowszych pozycji literaturowych, jak i opis wykonania poszczególnych eksperymentów.

Skrypt adresowany do osób zainteresowanych metabolizmem RNA oraz nowoczesnymi, molekularnymi technikami jego badania – studentów wszystkich kierunków Wydziału Biologii i Międzywydziałowych Indywidualnych Studiów Matematyczno-Przyrodniczych Uniwersytetu Warszawskiego.

Ewa Skowronek, https://orcid.org/
Sebastian Jeleń, https://orcid.org/
Analiza northern – detekcja RNA na filtrach. Wykrywanie prekursorów rRNA u drożdży
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.9-19

Katarzyna Kupidura-Pawlik, https://orcid.org/
Analiza northern – wykrywanie transkryptów CUT u drożdży
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.20-24

Michał Koper, https://orcid.org/
Katarzyna Kupidura-Pawlik, https://orcid.org/
Analiza oddziaływania białka z kwasem nukleinowym: test opóźnienia migracji w żelu (EMSA)
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.58-63

Michał Krzysztoń, https://orcid.org/
Badanie końców cząsteczek RNA na przykładzie drożdżowych prekursorów snoRNA. Technika cRT-PCR
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.33-38

Sylwia Szczepaniak, https://orcid.org/
Oznaczenia aktywności enzymów biorących udział w obróbce RNA
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.47-58

Michał Koper, https://orcid.org/
PCR ilościowy: RT-qPCR
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.39-46

Michał Krzysztoń, https://orcid.org/
Sztuczne microRNA – amiRNA
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.63-64

Elżbieta Turek, https://orcid.org/
Wykrywanie małych RNA
https://doi.org/10.31338/uw.9788323517559.pp.25-32